Sejarah terbentuk nya Desa Long Mutan merupakan nama pemberian dari para leluhur yang pertama kali mendiami dan bertempat tinggal di suatau daerah yang sekitaran  anak sungai  yang memiliki banyak kuburan kuno yang mana nama kuburan tersebut dalam basa daerah setempat adalah Mutan, dan nama anak sungai tersebut Arur Mutan, maka muncul lah nama Desa Long Mutan yang tergabung dari dua istilah tersebut, masyarakat desa Long Mutan mulai berkumpul satu persatu dan mendiami Daerah tersebut , awal mula nya masyarakat Desa Long Mutan Memiliki asal Usul yang berbeda kemudian berkumpul sehingga terbentuk nya desa tersebut, Desa long Mutan awal nya berpindah- pindah  tempat tinggal nya dikarenakan masyarakat desa long mutan memiliki cara bercocok tanam yaitu Berladang, ketika dalam daerah yang merak diami lahan nya suda tergarap habis oleh msayakat maka mereka akan berpindah kesuatu tempat lagi untuk berladang dan menafkai keluarga mereka masing- masing.

            Pemerintahan Kampung Long Mutan dalam pelaksaaan roda pemerintahan  telah  di pimpin oleh Ketua Kampung dan beberapa kepala Desa . Ketua Kampung dan kepala Desa pada saat itu dipilih berdasarkan derajat dan wibawa dari  seseorang pada saat itu. Tapi pada periode sekitar tahun 1931-1945 dipilih atas pemilihan musyawarah mufakat oleh masyarakatnya. Desa Long Mutan di pimpin Alm.Pun Baye, sebelum Kemerdekaan Indonesia .

Tahun1945-1950. Alm,pun Kuleng terpilih/memimpin Desa Long Mutan, selanjutnya pada tahun 1950-1970.Alm.pun Ubung terpilih sebagai kepala desa, Tahun1971-1983 Alm.Paul Agung.terpilih sebagai kepala Desa Long Mutan. tahun 1983-1995.pk.Tinus Rining.terpilih sebagai kepala desa Long Mutan. Tahun 1996-2005.Alm.pk.Soliman Gatum terpilih sebagai kepala Desa Long Mutan. dari Tahun 2005-2015 dipimpin Bapak.Yuni Pured Desa Long Mutan. pada tanggal 19 Desember 2014. Bapak Yullius Yagan dari sekritaris desa status PNS,di angkatmenadi pjs. Kepala Desa Long Mutan Masa tugas nya sampai terpilih kepala desa Yang baru tahun 2015/2016. Periode kepemimpinan Ketua Kampung sampai Kepala Desa tampak  pada  tabel  1 berikut ini :

NAMA-NAMA KETUA KAMPUNG DAN KEPALA DESA SEJAK TERBENTUKNYA DESA LONG MUTAN SAMPAI SAAT INI